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Atalia. Simulador de redes binarias

 

Capítulos en libros

Chaos, Á. (2018). Darwin ex machina. En: La biología evolutiva contemporánea: ¿Una revolución más en la ciencia? Muñoz, J. (coord).

Chaos Á (2015). Evolución biológica y desarrollo. En: Evolución orgánica. Piñero D, Becerra A, Sortibrán A. (eds).

 

Chaos Á (2014). El gen de Dios. Selección natural y autoorganización. En: Totalidades y complejidades: Critica de la ciencia reduccionista. Muñoz J (ed)

 

Chaos, Á (2014) A sound of flower. Evolutionary teachings from complex systems. In: Frontiers in Ecology, Evolution and Complexity. Benítez M, Miramontes O, Valiente A. (eds).

 

 

Álvarez-Buylla ER, Benítez M, Corvera A, Chaos Á, De Folter S, Gamboa de Buen A, Garay-Arroyo A, García-Ponce B, Jaimes-Miranda F, Pérez-Ruiz R, Piñeyro A, Sánchez-Corrales YE. (2010) Flower development. En: The Arabidopsis Book Number 8.

 

Álvarez-Buylla ER, Benítez M, Aldana M, Escalera-Santos GJ, Chaos Á, Padilla-Longoria P, Verduzco-Vázquez R. (2010) Gene regulatory models for plant developmenta and evolution. En: Plant developmental biology - Biotechnology perspectives. Vol. 1. Pua E, Davey M (ed). Springer Verlag, Berlin.

 

Álvarez-Buylla ER, Chaos Á. En busca de los monstruos esperanzados: desarrollo y evolución de la diversidad biológica (2009) En: Contra el obscurantismo: defensa de la laicidad, la educación sexual y el evolucionismo. Muñoz J (Coord.) UNAM-CEICH, México.

 

Álvarez-Buylla ER, Benítez M, Chaos Á, Cortés-Poza Y, Espinosa-Soto C, Padilla-Longoria P. De genes a patrones: una propuesta metodológica. En: La física biológica en México: temas selectos (2006). García-Colín L, Dagdug L, Miramontes P, Rojo A. El Colegio Nacional, México D.F.

 

Artículos

 

Álvarez-Buylla ER, Chaos Á, Aldana M, Benítez M, Cortés-Poza Y, Espinosa-Soto C, Hartasánchez D, Beau R, Malkin D, Escalera-Santos G, Padilla-Longoria P. (2008) Floral Morphogenesis: Stochastic Explorations of a Gene Network Epigenetic Landscape. PLoS ONE 3(11): e3626 doi:10.1371/journal.pone.0003626.

 

Balleza E, Álvarez-Buylla ER, Chaos Á, Kauffman S, Shmulevic I, Aldana M. (2008) Critical dynamics in genetic regulatory networks: examples from four kingdoms. PLoS ONE 3(6): e2456. doi:10.1371/journal.pone.0002456

 

Álvarez-Buylla ER, Benítez M, Balleza E, Chaos Á, Espinosa-Soto C, Padilla-Longoria P. (2007) Gene regulatory network models for plant development. Current Opinion in Plan Biology 10:83-91.

 

Chaos Á, Aldana M, Espinosa-Soto C, García Ponce de León B, Garay Arroyo A. and Álvarez-Buylla ER. (2006) From Genes to Flower Patterns and Evolution: Dynamic Models of Gene Regulatory Networks. Journal of Plant Growth Regulation 25:278-289.

 

Delgado P, Piñero D, Chaos Á, Pérez-Nasser N, Álvarez-Buylla ER. (1999) High population differentiation and genetic variation in the endangered Mexican pine Pinus rzedowskii (Pinaceae). American Journal of Botany 86(5):669-676

 

Álvarez-Buylla ER, Chaos Á, Piñero D, Garay A. (1996) Demographic genetics of a pioneer tropical tree species: patch dynamics, seed dispersal, and seed banks. Evolution 50(3):1155-1166.

 

Conferencias

 

Redes y complejidad. Facultad de Filosofía y Letras. UNAM. México.

 

La máscara del caos. Universidad de Valencia. Valencia, España.

 

Simulaciones evolutivas con redes genéticas binarias con Atalia. C3, UNAM. México.

 

Evolución biológica. Universidad de San Luis Potosí, SLP. México.

 

La escafandra y la mariposa. UAM. México

 

El gen de Dios. CEIICH, UNAM. México

 

Darwin contra álien. Universidad de Querétaro, Qro. México.

 

La fuerza obscura de la evolución. Facultad de Ciencias, UNAM. México.

 

Traducciones

 

Starr C. y Taggart R. (2008) Biología. La unidad y la diversidad de la vida. 11a edición. Thomson. Cengage learning, México.

 

Tyler Miller Jr. G. (2007) Ciencia ambiental. Desarrollo sostenible. Un enfoque integral. 8a edición. Thomson. Cengage learning, México

 

 

Revisiones técnicas

 

Tyler Miller G y Spoolman S. (2010). Principios de ecología. 5a edición. Thomson. Cengage learning, México.

 

Odum E, Barret G. (2006). Fundamentos de ecología. 5a edición. Thomson. Cengage learning, México.

 

Libros de texto

 

Prácticas 22, 35, 37, 40, 42, 45, 55, 63, 70, 76. Santos G y Chaos Á. Práctica 4. En: Manual de prácticas de biogeografía. (2008) Luis A, Castañeda A, Morrone JJ, Llorente J. (ed) UNAM, México.

 

Prácticas 10, 11, 19, 32, 33, 35, 41, 43. En: Manual de prácticas de sistemática. (2004) Morrone JJ, Castañeda A, Hernández B, Luis A. (ed) UNAM, México.

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